在生產食用菌的過程中秸稈是作為基料使用的，使用菌具有較高的營養價值和藥用價值，利用秸稈作為生產基質，能夠大大增加生產食用菌的原料來源，從而降低成本。
食用菌在生長過程中會大量降解和轉化秸稈類基質，食用菌菌絲在秸稈基質中分泌的胞外酶如漆酶、纖維素酶、聚糖酶等，可以降解纖維素、半纖維素和木質素，將粗纖維轉化為人類可食用的優質蛋白，把大分子物質分解成為小分子物質，再參與其他合成反應。菌絲在降解基質過程中，菌絲體自身也獲得營養和能量，租后在菌絲體內合成蛋白質、脂肪和其他成分。以作物秸稈為主要培養基質，在配合其他原料，可以進行多種食用菌栽培。例如使用麥秸栽培草菇、用玉米秸稈栽培草菇和平菇等。
以上所述便是在食用菌種生產過程中秸稈的用途。根據相關專家講述合理利用秸稈的結構疏松、透氣好、保水性強的特點栽培種植農作物，可以有效提高轉化率，達到高產的目的。最后切記，在生產食用菌中使用的秸稈是經過有機肥設備秸稈粉碎機的二次加工后才可以進行使用的。
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